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ASSOCIATIONS SYMBIOTIQUES
(University of sciences and technology in Oran, 2019-01-20) SELAMI Nawel
L’Algérie est un pays d’Afrique du Nord, largement ouvert sur la Méditerranée et constitue une entité écologique exceptionnelle caractérisée par une grande diversité biologique, permettant la coexistence de nombreuses espèces végétales et animales, souvent adaptées à des conditions abiotiques extrêmes ainsi qu’à de fortes pressions biotiques. Cependant ces ressources naturelles sont limitées et fragilisées du fait de l’aridité du climat d’une part et des activités humaines, d’autre part. En effet, l’utilisation des pesticides et des engrais chimiques pour augmenter la production végétale, engendre une menace pour l’état sanitaire des végétaux, des animaux, et présente une source d’altération de la qualité des produits. Cette conjoncture a engendré un débat global à l’échelle planétaire qui préconise de réhabiliter les Légumineuses dans la consommation humaine, la nourriture animale et les écosystèmes naturels pour des raisons que nous verrons au cœur de ce polycopié. La diversité de cette famille végétale qui comprend environ 20 000 espèces, offre des possibilités énormes d’exploitation. Ainsi les Légumineuses, par leurs intérêts agronomiques, alimentaires et écologiques, se trouvent actuellement au centre des préoccupations des instances internationales. Leur importance est due entre autres à leur contribution, chaque année environ 65 millions de tonnes d’azote atmosphérique intégrés dans la biosphère. Grâce à cette fixation d’azote réalisée en association avec les bactéries du sol collectivement appelées Rhizobia. Une importance considérable doit donc être attribuée au développement des possibilités offertes par cette association symbiotique fixatrice d’azote, dans les zones arides et semi arides, comme c’est le cas des pays du bassin méditerranéen et donc l’Algérie. Actuellement cette discipline est devenue très sollicitée vue la détérioration rapide de notre Environnement. Ce polycopié sera donc destiné aux Etudiants de Master 2 en Biotechnologie et Génomique végétale et toute personne qui s’intéresse à l’Association Symbiotique. Cette unité d’enseignement, a pour but de fournir aux Etudiants une formation théorique sur les Interactions plantes/ Microorganismes.
Biochimie et Physiologie Végétale : Nutrition
(University Of Sciences and Technoligies Of Oran, 2024-02-07) ERROUANE, KHEIRA
L’objectif principal du polycopié de cours intitulé: «Biochimie et Physiologie Végétale: Nutrition», est l’acquisition de compétences dans les domaines de physiologie et la biochimie végétale. Ce travail est un état des différentes notions de la nutrition chez les plantes, destiné principalement aux étudiants de Master I du parcours Biotechnologie et Valorisation des Plantes «MIBVP».
Biochimie et Physiologie Végétale Croissance et Développement
(University of Sciences and Technology of Oran, 2024-07-03) Khadidja, SMAIL
La physiologie végétale est la science qui étudie le fonctionnement des organes et des tissus végétaux et cherche à préciser la nature des mécanismes grâce auxquels les organes remplissent leurs fonctions. Elle se divise en deux grandes parties : Nutrition et métabolisme : qui se résument par - L’acquisition des éléments indispensables à la vie - La transformation de ces éléments et leur intégration dans la matière organique(dans la biomasse) Croissance et développement : représente l’ensemble des mécanismes pour le passage de l’état de vie ralentie à l’état reproducteur (cycle de développement). Le présent polycopié intitulé « BIOCHIMIE ET PHYSIOLOGIE VEGETALE : Croissance et Développement » constitue un support de cours destiné aux étudiants de première Année Master spécialité Biotechnologie et Valorisation des Plantes. Il vise à leur expliquer les mécanismes de la croissance et le développement des végétaux et les facteurs environnementaux et hormonaux qui les contrôlent
Bioinformatique et modélisation
(University of Science and Technology of Oran, 2020-12-04) SAD HOUARI Nawal
Ce cours intitulé « Bioinformatique et modélisation » est destiné aux étudiants de première année Master spécialité « Toxicologie Fondamentale et Appliquée ». Il contient l’essentiel du cours avec des exemples. Ce polycopié constitue un support de cours pour des étudiants n’ayant aucune connaissance en bioinformatique et modélisation. Il est aussi destiné à des étudiants ayant déjà une première expérience en bioinformatique et qui veulent connaître davantage sur l’art de la bioinformatique et la modélisation. La bioinformatique est devenue un outil incontournable pour comprendre le fonctionnement des génomes et des organismes vivants. L’objectif du module est de présenter les méthodes informatiques issues de l’algorithmique ou de la modélisation de systèmes complexes mises en œuvre pour l’analyse de données de biologie moléculaire. Cela comprend l’analyse de séquences (ADN, ARN, protéines) et la modélisation 3D.
Biologie des plantes à intérêts agroalimentaire et industriel
(University of Sciences and Technology of Oran, 2021-01-25) Sebaa, Hanane Sihem
Le maïs (Z. mays L.) est une plante annuelle monoïque de grande taille, à gaines se recouvrant les unes les autres et à limbes développées nettement distiques. Les plantes possèdent des épillets mâles en grappes spiciformes réunis sur une panicule terminale étalée et des inflorescences femelles insérées à l'aisselle des feuilles, dans lesquelles les épillets sont alignés en rangées (8 à 16) d'environ 30 épillets chacune, et sont portés sur un rachis presque ligneux épaissi. L'ensemble de la structure (épi) est enveloppé dans de nombreuses bractées foliacées développées (spathes), et une masse de longs stigmates s'échappent au sommet des spathes en une touffe de filaments (soies) (Hitchcock et Chase, 1971). 2.Répartition géograph
Biologie Moléculaire et Génie Génétique
(University of Sciences and Technology of Oran, 2023-10-04) Nadjet, Boushaba
Envisager de façon cohérente les multiples possibilités d’usage d’un même enseignement amène à réfléchir et conceptualiser une approche qui permet de constituer des ressources pédagogiques pouvant être automatiquement mises en forme pour les supports visés : que ce soit un polycopié rédigé qui sera imprimé ou visualisé dynamiquement sur une plateforme. Le but de ce polycopié est l’élaboration conceptuelle d’un cours de Biologie Moléculaire et Génie Génétique. Ce polycopié est divisé en deux parties présentant : les principes élémentaires et fondamentaux de la Biologie Moléculaire, les propriétés physiques et chimiques des acides nucléiques, l'expression et la transmission des informations génétiques ; les principales méthodes expérimentales d'étude. La deuxième partie traite des outils du Génie Génétique et les applications possibles notamment en santé humaine (production de protéines thérapeutiques, élimination de séquences virales persistantes), en agriculture biotechnologique (mise au point de nouvelles générations de plantes génétiquement modifiées) ou pour la mise au point d’outils destinés à explorer la fonction d’un gène. Le polycopié se termine par des références bibliographiques.
BIOLOGIE VEGETALE : Histologie et Anatomie Vegetales
(University of Sciences and Technology of Oran, 2021-01-31) CHAA, Lahouari
Ce présent manuel, a pour objectif de présenter les bases de la biologie Végétale pour les étudiants de première année, du domaine des Sciences de la Nature et de la Vie. Dans ce manuscrit, nous avons mis l’accent, essentiellement sur l’aspect anatomique et histologique du végétal.
Biotechnologie et génie génétique
(University of sciences and technology in Oran, 2019-01-23) ABDEDDAIM Katia Khadidja
Le présent polycopié constitue un support de cours destiné aux étudiants de master II spécialité biotechnologie végétale. Il vise à leur transmettre les moyens d’amélioration des plantes par des méthodes de technologies nouvelles après avoir acquis les techniques classiques de reproductions sexuée et végétative. Les méthodes biotechnologiques basées sur la culture in vitro, le transfert de gènes et la connaissance du patrimoine chromosomique permettent d’augmenter et d’améliorer la production végétale tout en l’adaptant à divers environnements et développer une meilleure résistance aux maladies et participent à la création de nouvelles espèces ou variétés. Le contenu de ce cours a pour objectif également de faciliter la compréhension des méthodes de génie génétique pour une application ultérieure sur le terrain.
Cartographie du génome
(University of Sciences and Technology of Oran, 2025-11-27) HAMOUDA, Linda
La cartographie du génome est une démarche scientifique visant à localiser précisément des gènes, des loci, des marqueurs ou des séquences spécifiques sur les chromosomes. Elle permet d’ordonner ces éléments et de mieux comprendre l’organisation générale du génome. Cette approche joue un rôle essentiel dans la génétique moderne, car elle facilite le clonage des gènes grâce à la connaissance précise de leur position et permet d’identifier les régions génomiques influençant des caractères d’intérêt tels que des maladies génétiques ou des traits complexes a composante quantitative. Elle contribue également à la comparaison des génomes entre différentes espèces, apportant ainsi des informations précieuses sur l’évolution du génome. Ce polycopié a pour objectif de faire découvrir aux étudiants le rôle de la cartographie du génome ainsi quede leur permettre de comprendre la structure et l’organisation du génome. Cela est abordé à travers l’étude des différents types de cartographie, qui constituent les divers chapitres de ce cours et qui se déclinent comme suit : 1-la carte chromosomique aussi appelée carte physique de faible résolution, 2-la carte génétique, fondée sur les fréquences de recombinaison, 3-la carte physique de haute résolution, qui localise les séquences à une échelle beaucoup plus précise. 4-la cartographie comparée Grace à ces outils, ce support vise à fournir une base solide pour les étudiants de première année master spécialité Génétique Fondamentale et Appliquée, tout en leur ouvrant des perspectives vers les approches les plus récentes en recherche biomédicale, en amélioration des espèces végétales et animales, en biotechnologie, ainsi que dans l’étude de l’évolution génomique. La cartographie constitue ainsi un fondement indispensable de la génomique moderne
Cellular Communication and Signaling
(University of Sciences and Technology of Oran, 2025-10-29) BENSABER, Hayette Sénia
Cellular communication is a fundamental process by which cells perceive and respond to their environment, ensuring the coordination of biological functions essential to maintaining homeostasis. This intercellular dialogue is based on the exchange of chemical, electrical, or mechanical signals, which can act locally (juxtacrine or paracrine communication) or remotely (endocrine or synaptic communication). Cell signaling mechanisms typically begin with the reception of an extracellular signal via a specific receptor located on the surface or within the target cell. This interaction activates a signal transduction cascade, often composed of protein kinases, second messengers (cAMP, Ca²⁺, IP3), and transcription factors. These cascades amplify the initial signal and lead to specific biological responses : activation or repression of genes, proliferation, differentiation, migration, or apoptosis. Key signaling pathways include G protein-coupled receptor (GPCR), receptor tyrosine kinase (RTK), JAK/STAT, Wnt/β-catenin, and nuclear receptor pathways. Each of these pathways is finely regulated and can interact with other pathways (crosstalk), giving the cell a high degree of response plasticity. Dysfunction in cell signaling is implicated in many human pathologies, including cancers, autoimmune, neurodegenerative, and metabolic diseases. Current research is exploring new therapeutic targets within these signaling pathways, with the goal of modulating cellular messages specifically and efficiently. Signaling biomarkers are also used in diagnosis and prognosis to assess the pathophysiological state of tissues.
Cellular Differentiation And Reproduction
(Mohamed Boudiaf University of Science and Technology of Oran (USTO-MB), 2026-06-11) Abdi Meriem
This course handout has been prepared for the Master of Science program in Cytogenetics. It covers the complete DCR curriculum across twenty interconnected chapters, spanning the molecular biology of gene expression and cellular differentiation, through the cytogenetics and physiology of human reproduction, to the developmental genetics of embryonic formation. Fourteen original scientific figures have been produced and integrated at the most pedagogically relevant positions within the text. Each figure is accompanied by a detailed legend that can stand independently as a study aid. Key clinical correlates have been expanded throughout: molecular mechanisms are consistently connected to the pathologies that arise from their disruption, ensuring that basic science learning is grounded in medical reality.
Chimie générale et Chimie organique
(University of Sciences and Technology of Oran, 2022-12-13) HENNAOUI, Feriel
Le présent polycopié de cours s’adresse aux étudiants en Socle commun des Enseignements de Base de Biologie (EBB), également aux étudiants qui reçoivent un enseignement général de Chimie de différentes spécialités. Le contenu de ce polycopié résume tout ce qu’un étudiant doit connaitre sur la chimie générale et la chimie organique. Il porte essentiellement sur les notions fondamentales de la structure de la matière et nomenclature en chimie organique. Ce polycopié comprend six chapitres, Le premier chapitre est consacré aux : - Processus de la radioactivité, les réactions nucléaires, la loi de décroissance radioactive, énergie de liaison-énergie de cohésion, courbe d’Aston et les applications de la radioactivité. Le deuxième chapitre concerne : - La structure de l’atome (noyau et électrons), le modèle de Bohr : calcul du rayon atomique et la quantification de l’énergie, cas de l’hydrogène, hydrogénoide et poly électronique. Description quantiques de l’atome d’hydrogène (nombre quantiques et configuration électroniques). La classification périodique des éléments. Variation de rayon atomique, énergie d’ionisation et l’électronégativité dans le tableau périodique Le troisième chapitre porte sur : - Schéma de Lewis, la valence des atomes, règle de l’octet, les liaisons fortes (entre atomes) : liaison covalente, liaison covalente dative, liaison ionique et liaison métallique. Les liaisons faibles (entre molécules) : liaison Hydrogène et liaison de Van der Waals. Théorie des orbitales moléculaires, hybridation et géométrie des édifices covalents : Règles de GILLESPIE. Le quatrième chapitre présume - Les équilibres d’oxydoréduction, l’écriture d’une réaction d’oxydoréduction et la construction d’une pile. Le cinquième chapitre est dédié aux : - Equilibres acido-basiques, les réactions acido-basiques, calcul du pH des différents équilibres et les dosages acido-basiques. Le dernier chapitre estréservé à la Chimie organique : isomérie et nomenclature des différents composés organiques.
Cours de Physiologie des Grandes Fonctions
(University of Science and Technology of Oran, 2020-09-21) Brahim Amina Cherifa
Ce cours contenant l'aspect de la Physiologie des Grandes Fonctions du corps humain: Sang, système nerveux, appareil cardiovasculaire, appareil respiratoire et appareil urinaire est destinés à l’usage des étudiants de 3ème Année Licence Nutrition Alimentation et Pathologie
Cytogénétique. Destiné aux étudiants L3, GENETIQUE
(University of Sciences and Technology of Oran, 2022-05-08) Ahlem Nora, MESSAL DJELTI
Ce polycopié est le support de cours de la matière Cytogénétique (unité d’enseignements fondamentale 2, UEF 3.2.2 : Génétique Humaine et Cytogénétique) destiné aux étudiants de troisième année licence LMD académique Génétique présentant un volume horaire semestriel de 72 heures pour 15 semaines d’enseignements. Cette formation permettra aux étudiants de reconnaître les chromosomes humains et de les Classer en un caryotype, comprendre les mécanismes cytogénétiques, résoudre les problèmes cytogénétiques, maitrise des techniques d’explorations, mettre en évidence les anomalies et proposer des thérapies adéquates. Le présent document a pour but de détecter les anomalies chromosomiques constitutionnelles ou acquises grâce à des techniques microscopiques techniques de coloration standards, techniques de bandes, afin d’établir un diagnostic biologique et d’assurer un conseil génétique. Ces anomalies peuvent être de nombre (plus ou moins de 46 chromosomes), de structure (modification dans la succession de plusieurs locus) ou de réparation ou cassures chromosomiques.
Ecologie des microorganismes
(University of Sciences and Technology of Oran, 2025-05-29) Rajaa, CHAMEKH
Le polycopié des Travaux Pratiques du module « Écologie des Microorganismes », destiné aux étudiants de Master 1 en Microbiologie Appliquée, se compose de quatre séances principales, chacune visant à illustrer un aspect fondamental de l’écologie microbienne à travers des expériences pratiques. Le TP1 est consacré à la colonne de Winogradsky, un micro-écosystème simulant les gradients environnementaux et permettant d'observer la stratification des communautés microbiennes et les cycles biogéochimiques (carbone et soufre). Le TP2 étudie l’effet antagoniste de Trichoderma sur des champignons phytopathogènes, illustrant le potentiel de ce genre fongique en biocontrôle agricole. Le TP3 porte sur l’isolement et l’identification des bactéries provenant de divers écosystèmes à l’aide de techniques de culture, de coloration de Gram et de tests biochimiques, avec un focus sur les entérobactéries, les Pseudomonas et les Bacillus. Enfin, le TP4 explore l’activité enzymatique des microorganismes (amylase, cellulase, protéase, lipase), essentielle pour la dégradation de la matière organique et les applications biotechnologiques. Ce document met l’accent sur l'acquisition de compétences pratiques et l’interprétation écologique des résultats, contribuant à la formation des étudiants dans le domaine de la microbiologie environnementale
Ecosystème microbiens impact-santé-environnement
(University of Sciences and Technology of Oran, 2024-11-05) Zahia, BENMOUNA
Le présent manuscrit est destiné aux étudiants de 2ème année master de spécialité microbiologie appliquée, il est constitué de quatre chapitres. Le premier chapitre développe la description du plus important écosystème microbien qui est celui de l’environnement marin ainsi que son fonctionnement et le rôle de leurs microorganismes dans la biodégradation de la matière organique et dans l’auto-épuration des eaux souterraines. Le deuxième chapitre concerne l’écosystème microbien terrestre, et le rôle de leurs microorganismes dans la fertilisation et la dépollution du sol. Le troisième chapitre décrit l’impact environnemental et la qualité de l'environnement. Le terme éco-toxicologie et les effets des polluants sur l’environnement sont aussi discutés dans ce chapitre. Enfin, le dernier chapitre englobe les réservoirs microbiens, la dissémination et la santé publique, dans lequel des écosystèmes microbiens jouant le rôle de réservoirs de bactéries pathogènes ont été développés.
Évaluation des risques toxicologiques
(University of Sciences and Technology of Oran, 2023-10-07) Amina, KADDOUR
Ce polycopié dresse une présentation générale du module enseigné (évaluation des risques toxicologiques), dont l’objectif principal est la compréhension de la démarche relative à l’évaluation des risques toxicologiques par l’acquisition de méthodes utilisés pour préciser la dangerosité de xénobiotiques pour l’homme. Les études de la toxicité aiguëet chronique, de tolérance locale sont particulièrement développéess’y ajoutent, dans un but pratique, la présentation de tests de cytotoxicité et des bonnes pratiques de laboratoire, ainsi que l’exploitation d’enquêtes épidémiologiques et de données de toxicovigilance.Ce module semestriel est destiné aux étudiants Master 1, spécialité Toxicologie Fondamentale Appliquée. Ces derniers doivent justifier d’un diplôme de Licence dans les disciplines demandées et avoir suivi tout le cursus prévu dans cette spécialité. Ils doivent aussi avoir des connaissances en Biologie cellulaire, Biochimie et en Chimie. Au terme de cet enseignement, les étudiants sont censés être apte à caractérisé le risque toxique en suivant une démarche systémique.Il est à rappeler que le mode dévaluation des connaissances acquises par les étudiants est basé sur le contrôle continu, le travail personnel (TD), et un examen à la fin du semestre.
Evaluation toxicologique et pharmacologique des plantes médicinales
(University of Sciences and Technology of Oran, 2026-02-25) BOKHARI, Hassiba
Ce polycopié est destiné aux étudiants de première année de Master en Biotechnologie et Valorisation des Plantes conformément au programme du Comité Pédagogique National (CPN), pour acquérir les notions générales et fondamentales nécessaires à la compréhension des grands principes de la toxicologie et de décrire les différents types de toxicité. De plus, il aborde les enjeux liés à l'évaluation des risques associés aux plantes médicinales et décrit les effets des substances toxiques sur différents organes cibles. Cela semble être un outil précieux pour les étudiants qui souhaitent approfondir leur compréhension des aspects toxicologiques liés aux plantes et à leurs produits.
General Microbiology
(University of Sciences and Technology of Oran, 2026-04-14) Harir, Mohammed
Generally microbes can be divided into two categories: the cellular microbes (or organisms) and the acellular microbes (or agents). In the cellular camp we have the bacteria, the archaea, the fungi, and the protists (a bit of a grab bag composed of algae, protozoa, slime molds, and water molds). Cellular microbes can be either unicellular, where one cell is the entire organism, or multicellular, where hundreds, thousands or even billions of cells can make up the entire organism. In the acellular camp we have the viruses and other infectious agents, such as prions and viroids. In this textbook the focus will be on the bacteria and archaea (traditionally known as the “prokaryotes,”) and the viruses The scale of the “invisible world’; There are a thousand millimetres in a metre. There are a thousand microns (micrometres) in a millimetre, an E. coli bacterium is about a micron long – so a million of them lined up form a line a metre long, a cell of bakers yeast (a fungus) is about 10-15 microns in diameter. Some microscopic pond life is invisible to the naked eye, some are “just” visible. Viruses are very tiny, only a fraction of a micron (say 20 - 100 nanometres - billionths of a metre). Bacteria, fungi, and protozoa can be seen in a light microscope, but except for the larger protozoans, not with much internal detail. Viruses cannot be seen using a light microscope. Viruses can easily be seen using a transmission electron microscope, extensive details of cells can be analysed with an electron microscope. The “Branches” of microbiology; Bacteriologists - study bacteria, there are medical, agricultural, biotechnological Specializations. Mycologists - study fungi, there are medical, agricultural, biotechnological Specializations. Protozoologists, study small “animal - like” single celled organisms such as amoeba, and various disease causing parasites. Phycologists study algae. The study of lichens can also be regarded as a sub discipline of microbiology Parasitologists- a term generally used to describe those who study small animals as agents of disease (like some microscopic worms for instance) but also used to describe those who study protozoan pathogens. Immunology is often taught and researched in microbiology faculties
Genetic Engineering
(Mohamed Boudiaf University of Science and Technology of Oran (USTO-MB), 2026-06-11) Abdi Meriem
Genetic engineering stands today as one of the most transformative disciplines in modern biological sciences. Over the past five decades, advances in molecular biology have made it possible not only to understand the structure and function of genes, but also to manipulate them with remarkable precision. What began as fundamental research into the molecular nature of DNA has evolved into a powerful technological framework that now influences medicine, agriculture, environmental science, and industrial biotechnology. This course manual is designed for third-year undergraduate (L3) students in biological sciences, biotechnology, biochemistry, and related fields. Its objective is to provide a solid conceptual foundation while also introducing the practical tools and experimental strategies that define contemporary genetic engineering. The content bridges theoretical knowledge and laboratory application, allowing students to understand both the “why” and the “how” of molecular manipulation. Throughout this manual, students will explore the core principles of recombinant DNA technology, including restriction enzymes, cloning vectors, host systems, polymerase chain reaction (PCR), DNA sequencing technologies, genomic and cDNA libraries, and modern genome editing tools such as CRISPR-Cas systems. Emphasis is placed not only on the mechanisms underlying these techniques but also on their applications in real-world contexts, including recombinant protein production, transgenic organisms, gene therapy, and next-generation sequencing.