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    Travaux dirigés de Biologie Moléculaire
    (Mohamed Boudiaf University of Science and Technology of Oran (USTO-MB), 2026-06-02) LAROUCI Saliha
    La biologie moléculaire est une discipline scientifique au croisement de la génétique, de la biochimie et de la physique, dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire. La biologie moléculaire est apparue au XXe siècle, à la suite de l'élaboration des lois de la génétique, la découverte des chromosomes et l'identification de l'ADN comme support chimique de l'information génétique. Après la découverte de la structure en double hélice de l'ADN en 1953 par James Watson (1928-), Francis Crick (1916-2004), Maurice Wilkins (1916-2004) et Rosalind Franklin (1920-1958), la biologie moléculaire a connu d'importants développements pour devenir un outil incontournable de la biologie moderne à partir des années 1970. Depuis la fin des années 1950 et le début des années 1960, les biologistes moléculaires ont appris à caractériser, isoler et manipuler les composants moléculaires des cellules et des organismes. Ces composants incluent l'ADN, support de l'information génétique, l'ARN, et les protéines, molécules structurelles et enzymatiques les plus importantes des cellules. Ce polycopié est le support de travaux dirigés de la matière Biologie Moléculaire Unité d’enseignement fondamentale 1 (UEF 3.2.1) destiné aux étudiants de troisième année licence LMD académique Biochimie. L’objectif des travaux dirigés de la matière Biologie moléculaire est d'appliquer les connaissances apprises pendant les cours théoriques par le biais d’une série de 05 travaux dirigés sur : Structure et dynamique de l’ADN, Réplication de l’ADN, Mutation et mutagenèse, : Régulation de l’expression des gènes et méthodologie en biologie moléculaire Le polycopié est divisé en deux parties : la première partie concerne les énoncés des exercices proposés pour chaque fiche de TD avec un rappel de cours de la biologie moléculaire qui permettra aux étudiants de comprendre la structure et l’organisation du génome avec toute sa complexité de transcription, traduction, régulation transcriptionnelle et traductionnelle. Ainsi que les techniques de bases (PCR, séquençage, électrophorèse). Tandis que la seconde partie présente également l'ensemble des solutions aux exercices proposées.
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    General Microbiology
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2026-04-14) Harir, Mohammed
    Generally microbes can be divided into two categories: the cellular microbes (or organisms) and the acellular microbes (or agents). In the cellular camp we have the bacteria, the archaea, the fungi, and the protists (a bit of a grab bag composed of algae, protozoa, slime molds, and water molds). Cellular microbes can be either unicellular, where one cell is the entire organism, or multicellular, where hundreds, thousands or even billions of cells can make up the entire organism. In the acellular camp we have the viruses and other infectious agents, such as prions and viroids. In this textbook the focus will be on the bacteria and archaea (traditionally known as the “prokaryotes,”) and the viruses The scale of the “invisible world’; There are a thousand millimetres in a metre. There are a thousand microns (micrometres) in a millimetre, an E. coli bacterium is about a micron long – so a million of them lined up form a line a metre long, a cell of bakers yeast (a fungus) is about 10-15 microns in diameter. Some microscopic pond life is invisible to the naked eye, some are “just” visible. Viruses are very tiny, only a fraction of a micron (say 20 - 100 nanometres - billionths of a metre). Bacteria, fungi, and protozoa can be seen in a light microscope, but except for the larger protozoans, not with much internal detail. Viruses cannot be seen using a light microscope. Viruses can easily be seen using a transmission electron microscope, extensive details of cells can be analysed with an electron microscope. The “Branches” of microbiology; Bacteriologists - study bacteria, there are medical, agricultural, biotechnological Specializations. Mycologists - study fungi, there are medical, agricultural, biotechnological Specializations. Protozoologists, study small “animal - like” single celled organisms such as amoeba, and various disease causing parasites. Phycologists study algae. The study of lichens can also be regarded as a sub discipline of microbiology Parasitologists- a term generally used to describe those who study small animals as agents of disease (like some microscopic worms for instance) but also used to describe those who study protozoan pathogens. Immunology is often taught and researched in microbiology faculties
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    Hygiene and Safety in the Laboratory
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2026-04-09) Dib, Wafaa
    In the context of scientific research and technological development, laboratories are indispensable environments for experimentation, innovation, and applied learning. However, the laboratory setting is also a high-risk area, particularly when handling chemical, biological, or radiological agents. For students specializing in Plant Biotechnology and Genomics, a strong foundation in laboratory hygiene and safety is essential, not only for personal protection but also for ensuring the validity and reproducibility of experimental results. This course, “Hygiene and Safety in the Laboratory”, is intended for third-year undergraduate students specializing in Plant Biotechnology and Genomics. It is specifically designed to equip students with the essential knowledge and skills required to work safely and responsibly in research and diagnostic laboratories. The course emphasizes the principles of biosafety, chemical safety, radiation protection, and emergency response, all within the framework of plant biotechnology and molecular biology practices. The first chapter introduces general safety and hygiene rules, including the identification of potential hazards, the use of personal protective equipment (PPE), and the adoption of behaviors that minimize exposure to dangerous agents. Students will learn how to assess risk in experimental procedures and maintain a clean and organized workspace to prevent contamination. The second chapter focuses on chemical risks, a central concern in molecular biology and biotechnology laboratories. This section covers the classification of chemicals, their physical and toxicological properties, and their effects on health and the environment. Students will also learn proper techniques for the storage, handling, labeling, and disposal of chemical products, in accordance with international safety standards. The third chapter addresses good laboratory practices (GLP), which are essential for maintaining a clean and safe working environment. Topics include bench-top safety, risk assessment procedures, proper maintenance, cleaning, disinfection, and decontamination of equipment. This chapter also introduces the fundamentals of radiation protection, covering both ionizing and non-ionizing radiation, in accordance with national (Algerian) and international standards. In addition, it presents laser safety protocols, highlighting the risks associated with optical radiation and the protective measures required, especially relevant in molecular visualization and analytical techniques used in plant genomics. The final chapter addresses the management of accidental and emergency situations, including fire risks, chemical spills, and evacuation procedures. Students will explore practical methods for risk mitigation and emergency preparedness, with simulations of real-world laboratory incidents. By the end of the course, students will be able to integrate hygiene and safety principles into their daily laboratory work, conduct risk assessments, respond appropriately to incidents, and contribute to a safe and compliant research environment. These competencies are not only essential for academic success but also form the basis for professional practice in biotechnology and genomics research.
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    Microbiologie industrielle
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2026-03-10) KALBAZA, Khadidja
    Ce cours présente d’abord les principales applications de la microbiologie industrielle, ainsi que les micro-organismes d’intérêt industriel et les milieux de culture nécessaires à leur croissance et à leur production. Il aborde également les procédés de fermentation industrielle, en décrivant la conception et le fonctionnement des fermenteurs, ainsi que les paramètres permettant de contrôler et d’optimiser les fermentations. Enfin, le cours traite de la production de biomasse et de métabolites microbiens, en mettant en évidence les techniques utilisées pour améliorer les rendements et valoriser différentes sources de substrats, notamment les sous-produits agricoles et industriels. L’ensemble de ces notions permet de comprendre le rôle essentiel des micro-organismes dans le développement des biotechnologies et des procédés industriels modernes.
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    Practical Guide in Geology
    (university of science and technology of oran, 2026-03-09) MAHBOUBI, Abdassamad
    Geology is a fundamental science that operates across multiple scales, from crystal structures to large-scale tectonic plate movements. It provides essential insights into the origin of life, the evolution of ecosystems, and the environmental conditions that shaped biodiversity through time. Geological knowledge helps biologists understand species dispersal, soil formation, and past climate changes through the study of sediments, fossils, and ice cores. Geology also plays a key role in identifying natural and anthropogenic pollution sources. This book presents eight thematic tutorials designed mainly for biology students, covering mineralogy, rock types, topography, and geological mapping, providing essential tools for understanding Earth processes and their ecological implications
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    Geology
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2026-03-09) MAHBOUBI, Abdassamad
    This book introduces geology to students with limited background in the field, particularly those studying Biology at the bachelor’s and master’s levels. It highlights geology as a fundamental science closely linked to human history, natural resources, and the evolution of life on Earth. The text emphasizes the strong relationship between geology and biology through disciplines such as paleontology, paleobotany, and biogeography, showing how geological processes have influenced biological evolution and ecosystems. Geology is also presented as an interdisciplinary science connected to physics, chemistry, and environmental studies. The book is organized into three chapters covering Earth’s structure, external geodynamics, and internal geodynamics (
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    Evaluation toxicologique et pharmacologique des plantes médicinales
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2026-02-25) BOKHARI, Hassiba
    Ce polycopié est destiné aux étudiants de première année de Master en Biotechnologie et Valorisation des Plantes conformément au programme du Comité Pédagogique National (CPN), pour acquérir les notions générales et fondamentales nécessaires à la compréhension des grands principes de la toxicologie et de décrire les différents types de toxicité. De plus, il aborde les enjeux liés à l'évaluation des risques associés aux plantes médicinales et décrit les effets des substances toxiques sur différents organes cibles. Cela semble être un outil précieux pour les étudiants qui souhaitent approfondir leur compréhension des aspects toxicologiques liés aux plantes et à leurs produits.
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    Valorisation des plantes médicinale et aromatique
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2025-01-18) Hanane Sihem, SEBAA
    Ce documents traite toutes les maladies et le role des plantes aromatiques et médicinales dans la medicine douce
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    Techniques d'analyse microbiologique
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2025-12-22) DELLALI, Amina
    Le cours Techniques d’analyse microbiologiques pour objectif d’initier les étudiants de L3 microbiologie aux principales méthodes utilisées pour l’étude, l’identification et la caractérisation des microorganismes. Il est structuré en quatre chapitres complémentaires. Le premier chapitre traite des méthodes spectrales, utilisées pour l’analyse qualitative et quantitative des composés microbiens à partir de leurs interactions avec la lumière. Le deuxième chapitre est consacré aux méthodes de fractionnement, qui permettent de séparer les différents constituants cellulaires afin d’étudier leur organisation et leurs fonctions. Le troisième chapitre aborde les méthodes de marquage, essentielles pour la détection et la localisation de molécules ou de structures spécifiques au sein des cellules microbiennes. Enfin, le quatrième chapitre porte sur la microscopie électronique, une technique offrant une haute résolution pour l’observation de l’ultrastructure des microorganismes. Ce cours fournit aux étudiants les bases théoriques nécessaires à la compréhension et à l’utilisation des principales techniques d’analyse en microbiologie.
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    Cartographie du génome
    (University of Sciences and Technology of Oran, 2025-11-27) HAMOUDA, Linda
    La cartographie du génome est une démarche scientifique visant à localiser précisément des gènes, des loci, des marqueurs ou des séquences spécifiques sur les chromosomes. Elle permet d’ordonner ces éléments et de mieux comprendre l’organisation générale du génome. Cette approche joue un rôle essentiel dans la génétique moderne, car elle facilite le clonage des gènes grâce à la connaissance précise de leur position et permet d’identifier les régions génomiques influençant des caractères d’intérêt tels que des maladies génétiques ou des traits complexes a composante quantitative. Elle contribue également à la comparaison des génomes entre différentes espèces, apportant ainsi des informations précieuses sur l’évolution du génome. Ce polycopié a pour objectif de faire découvrir aux étudiants le rôle de la cartographie du génome ainsi quede leur permettre de comprendre la structure et l’organisation du génome. Cela est abordé à travers l’étude des différents types de cartographie, qui constituent les divers chapitres de ce cours et qui se déclinent comme suit : 1-la carte chromosomique aussi appelée carte physique de faible résolution, 2-la carte génétique, fondée sur les fréquences de recombinaison, 3-la carte physique de haute résolution, qui localise les séquences à une échelle beaucoup plus précise. 4-la cartographie comparée Grace à ces outils, ce support vise à fournir une base solide pour les étudiants de première année master spécialité Génétique Fondamentale et Appliquée, tout en leur ouvrant des perspectives vers les approches les plus récentes en recherche biomédicale, en amélioration des espèces végétales et animales, en biotechnologie, ainsi que dans l’étude de l’évolution génomique. La cartographie constitue ainsi un fondement indispensable de la génomique moderne