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Génétique et pathologie moléculaire
(University of sciences and technology in Oran, 2019-01-20) Abderrahman Rym Khadidja
La matière Génétique et pathologie moléculaire appelée dans l’ancien canevas Biologie Moléculaire Appliquée II, est une application de toutes les connaissances acquises durant le 1er semestre avec le module Biologie Moléculaire Appliquée I. En effet, ce module permet d’étudier en profondeur différentes pathologies humaines sur leurs différents aspects : Clinique, génétique, épigénétique et éventuellement traiter les différentes techniques de biologie Moléculaire pour le diagnostic, pronostic et le traitement de ses pathologies. Ce module permet aux étudiants d’intégrer des notions relatives aux méthodes d'analyse et approches technologiques et d’assurer une formation pratique dans le domaine de la pathologie moléculaire à visée diagnostique avec pour champs d'application la génétique moléculaire.
ASSOCIATIONS SYMBIOTIQUES
(University of sciences and technology in Oran, 2019-01-20) SELAMI Nawel
L’Algérie est un pays d’Afrique du Nord, largement ouvert sur la Méditerranée et constitue une entité écologique exceptionnelle caractérisée par une grande diversité biologique, permettant la coexistence de nombreuses espèces végétales et animales, souvent adaptées à des conditions abiotiques extrêmes ainsi qu’à de fortes pressions biotiques. Cependant ces ressources naturelles sont limitées et fragilisées du fait de l’aridité du climat d’une part et des activités humaines, d’autre part. En effet, l’utilisation des pesticides et des engrais chimiques pour augmenter la production végétale, engendre une menace pour l’état sanitaire des végétaux, des animaux, et présente une source d’altération de la qualité des produits. Cette conjoncture a engendré un débat global à l’échelle planétaire qui préconise de réhabiliter les Légumineuses dans la consommation humaine, la nourriture animale et les écosystèmes naturels pour des raisons que nous verrons au cœur de ce polycopié. La diversité de cette famille végétale qui comprend environ 20 000 espèces, offre des possibilités énormes d’exploitation. Ainsi les Légumineuses, par leurs intérêts agronomiques, alimentaires et écologiques, se trouvent actuellement au centre des préoccupations des instances internationales. Leur importance est due entre autres à leur contribution, chaque année environ 65 millions de tonnes d’azote atmosphérique intégrés dans la biosphère. Grâce à cette fixation d’azote réalisée en association avec les bactéries du sol collectivement appelées Rhizobia. Une importance considérable doit donc être attribuée au développement des possibilités offertes par cette association symbiotique fixatrice d’azote, dans les zones arides et semi arides, comme c’est le cas des pays du bassin méditerranéen et donc l’Algérie. Actuellement cette discipline est devenue très sollicitée vue la détérioration rapide de notre Environnement. Ce polycopié sera donc destiné aux Etudiants de Master 2 en Biotechnologie et Génomique végétale et toute personne qui s’intéresse à l’Association Symbiotique. Cette unité d’enseignement, a pour but de fournir aux Etudiants une formation théorique sur les Interactions plantes/ Microorganismes.
Biotechnologie et génie génétique
(University of sciences and technology in Oran, 2019-01-23) ABDEDDAIM Katia Khadidja
Le présent polycopié constitue un support de cours destiné aux étudiants de master II spécialité biotechnologie végétale. Il vise à leur transmettre les moyens d’amélioration des plantes par des méthodes de technologies nouvelles après avoir acquis les techniques classiques de reproductions sexuée et végétative. Les méthodes biotechnologiques basées sur la culture in vitro, le transfert de gènes et la connaissance du patrimoine chromosomique permettent d’augmenter et d’améliorer la production végétale tout en l’adaptant à divers environnements et développer une meilleure résistance aux maladies et participent à la création de nouvelles espèces ou variétés. Le contenu de ce cours a pour objectif également de faciliter la compréhension des méthodes de génie génétique pour une application ultérieure sur le terrain.
Thermodynamique des transports membranaires
(University of sciences and technology in Oran, 2019-05-14) DIB Wafaa
Ce document présente des notions de base sur la structure et le rôle des membranes plasmiques dans le fonctionnement cellulaire. La cellule est une unité fondamentale, structurale et fonctionnelle des organismes vivants. Elle peut remplir toutes les fonctions de l’organisme, à savoir le métabolisme, le mouvement, la croissance, la reproduction ou encore la transmission de gènes. C’est une entité vivante qui fonctionne de manière autonome, tout en restant coordonnée avec les autres. On en distingue deux types : les cellules eucaryotes et les cellules procaryotes : La cellule est une unité vivante. Elle se nourrit en puisant dans le milieu extracellulaire les nutriments nécessaires au maintien de son activité et de sa croissance. Elle rejette dans ce même milieu les produits de dégradation inutiles ou toxiques. Par le caractère hydrophobe de sa couche lipidique, la membrane plasmique de la cellule ne permet pas le passage de molécules polaires (électrolytes) et de macromolécules. Celle-ci est cependant semi-perméable, car la cellule doit réguler ses concentrations ioniques. L’ensemble des échanges vont ainsi se faire à travers la membrane plasmique ou à l’aide de protéines transmembranaires. Il existe deux modes de transport moléculaires : le transport passif et le transport actif Des recherches réalisées depuis sur les membranes biologiques et modèles ont conduit à des modifications importantes du modèle de Singer et Nicolson. Des études fonctionnelles portant sur le trafic de protéines et de lipides ont suggéré que les lipides et protéines membranaires n’étaient pas distribués de façon aléatoire dans la membrane (Lisanti and Rodriguez-Boulan, 1990; van Meer and Simons, 1988). Elles ont conduit à l’émergence d’une nouvelle approche de la structure des membranes biologiques, les présentant comme des mélanges hétérogènes organisés en domaines dont certains exercent des fonctions biologiques importantes. Les membranes lipidiques modèles, même si elles ne rendent pas compte de la complexité des membranes cellulaires et notamment ni de l’asymétrie de répartition des lipides, ni des interactions protéines-protéines, ont concouru à la connaissance actuelle des membranes biologiques et représentent en ce sens un outil indispensable à leur étude. Enfin, ce document traite les membranes biologiques, le principe de la thermodynamique, la genèse des membranes biologiques, les aspects dynamiques du transport membranaire et enfin l’implication des membranes biologiques dans certains processus patho-physiologiques.
Toxicologie
(University of sciences and technology in Oran, 2019-12-17) BOKHARI Hassiba,
La toxicologie provient du terme grec « toxicon » qui signifie « arc ».La toxicologie est la science qui traite des toxiques, de leur nature, de leurs propriétés physiques et chimiques, de leurs actions sur l'organisme, des méthodes pour les rechercher, les identifier et des moyens pour traiter leurs effets nocifs. Ce cours est déstiné aux étudiants L 3 Nutrition Alimentaire et Pathologique
Transport chez les plantes
(University of Science and Technology of Oran, 2020-09-01) ERROUANE KHEIRA
Ce polycopié est destiné principalement aux étudiants de Master I du parcours Biotechnologie et Génomique Végétales «BGV». L’objectif principal de ce cours intitulé «Transport chez les Plantes» est l’acquisition de compétences dans les domaines de physiologie végétale et la biologie moléculaire. Aussi ce travail est un état des différentes notions du transport des ions, des assimilats chez les plantes et leurs applications biotechnologiques, de la biologie cellulaire ainsi la biochimie de la paroi. Ce cours est divisé en trois chapitres: - Le premier est consacré à l’étude d’organisation générale des tissus conducteurs; - Le second concerne l’étude de la différenciation des cellules conductrices; - Le troisième chapitre est destiné à l’étude de la conduction des sèves;
Cours de Physiologie des Grandes Fonctions
(University of Science and Technology of Oran, 2020-09-21) Brahim Amina Cherifa
Ce cours contenant l'aspect de la Physiologie des Grandes Fonctions du corps humain: Sang, système nerveux, appareil cardiovasculaire, appareil respiratoire et appareil urinaire est destinés à l’usage des étudiants de 3ème Année Licence Nutrition Alimentation et Pathologie
Bioinformatique et modélisation
(University of Science and Technology of Oran, 2020-12-04) SAD HOUARI Nawal
Ce cours intitulé « Bioinformatique et modélisation » est destiné aux étudiants de première année Master spécialité « Toxicologie Fondamentale et Appliquée ». Il contient l’essentiel du cours avec des exemples. Ce polycopié constitue un support de cours pour des étudiants n’ayant aucune connaissance en bioinformatique et modélisation. Il est aussi destiné à des étudiants ayant déjà une première expérience en bioinformatique et qui veulent connaître davantage sur l’art de la bioinformatique et la modélisation. La bioinformatique est devenue un outil incontournable pour comprendre le fonctionnement des génomes et des organismes vivants. L’objectif du module est de présenter les méthodes informatiques issues de l’algorithmique ou de la modélisation de systèmes complexes mises en œuvre pour l’analyse de données de biologie moléculaire. Cela comprend l’analyse de séquences (ADN, ARN, protéines) et la modélisation 3D.
Génétique des populations
(University of Science and Technology of Oran, 2020-12-08) ABDI Meriem
Ce polycopié est le support de cours de la matière Génétique des populations (unité d’enseignements fondamentaux 2, UEF 3.1.1) destiné aux étudiants de troisième année licence LMD académique Biotechnologie et Génomique Végétale avec un volume horaire semestriel de 67H30 pour 14 semaines. Il apporte une aide aux étudiants et permettra d’approfondir leurs connaissances, d’améliorer leurs compétences et de s’entraîner sur des exercices d’application. Le présent polycopié est divisé en deux parties : la première partie concerne la partie cours et est réparti en dix chapitres : notions d’espèce et de population, diversité génétique des populations, composition génétique d’une population, panmixie & équilibre de HardyWeinberg, test de la loi de Hardy-Weinberg dans les populations naturelles, le test de conformité  2 , influence des pressions évolutives, régime de reproduction, génétique des populations microbienne et introduction à la génétique quantitative. Chaque chapitre est subdivisé en un certain nombre de sous chapitres. La deuxième partie concerne les exercices d’application qui sont d’une difficulté variable et visent à donner l’occasion aux étudiants pour tester leurs connaissances. Ce cours ne contient pas les solutions des exercices proposés.
LES INDICES BIOLOGIQUES EN HALIEUTIQUE
(University of Science and Technology of Oran, 2020-12-29) KHERRAZ ALI
Ce document porte sur « Les indices biologiques en halieutique ». Ce TD est destiné aux étudiants de 3ème année Licence «Halieutique » au niveau du Département des Sciences de la Mer et de l’Aquaculture à l’Université de Mostaganem. Ces Travaux dirigés sont inspirés du programme proposé dans le canevas de la Licence Halieutique pour la matière Halieutique II
TOXICOLOGIE DE LA REPRODUCTION
(University of Science and Technology of Oran, 2020-12-29) BENGHALI Sofiane Med el Amine
Ce manuel regroupe des informations pédagogiques et scientifiques qu’un étudiant de Master Toxicologie Fondamentale Appliquée doit savoir sur la Toxicologie de la Reproduction, il explique toutes les bases de ce cours de façon chronologique. Ce document est un outil d’enseignement universitaire, il s’adresse principalement aux étudiants en biologie (Master) et a pour objectif d’initié les étudiants a cette nouvelle discipline et leurs permettre d’apprendre a ’évaluer le risque encouru tout au long d’un cycle de reproduction. Ils vont ainsi étudier l’impact d’un xénobiotique sur les fonctions de reproduction mâle et femelle, la gestation et le développement embryonnaire et foetal, la mise bas et le développement postnatal des jeunes. L’interprétation des résultats et le calcul des marges de sécurité permettra une évaluation du risque raisonnée et la réalisation de recommandations tant dans le résumé des caractéristiques du produit qu’auprès des prescripteurs - La première partie comprend un descriptif des différentes cibles toxicologiques de la reproduction et du développement. - La deuxième partie comprend les généralités Perturbateurs endocriniens et la reproduction masculine et féminine. - La troisième partie est consacrée aux principes de base de l’Epidémiologie de la reproduction. - La quatrième partie est consacré a l’étude de Toxicologie de la grossesse. - Et enfin une cinquième et dernière partie qui résume les aspects les plus pertinents de la Radiosensibilité des cellules germinales. Ce Manuel est inspiré du programme proposé dans le canevas de Master Toxicologie Fondamentale Appliquée pour la matière Toxicologie de la Reproduction.
Téchnologie des industries agro-alimentaires
(University of Science and Technology of Oran, 2021-01-07) BESBES Mounia
Ce cours est destiné aux étudiants de l'université des sciences et de la technologie d’Oran de la faculté des sciences de la nature et de la vie,en master 1 spécialité qualité des produits et sécurité alimentaire et à toute autre personne intéressée par la science
Biologie des plantes à intérêts agroalimentaire et industriel
(University of Sciences and Technology of Oran, 2021-01-25) Sebaa, Hanane Sihem
Le maïs (Z. mays L.) est une plante annuelle monoïque de grande taille, à gaines se recouvrant les unes les autres et à limbes développées nettement distiques. Les plantes possèdent des épillets mâles en grappes spiciformes réunis sur une panicule terminale étalée et des inflorescences femelles insérées à l'aisselle des feuilles, dans lesquelles les épillets sont alignés en rangées (8 à 16) d'environ 30 épillets chacune, et sont portés sur un rachis presque ligneux épaissi. L'ensemble de la structure (épi) est enveloppé dans de nombreuses bractées foliacées développées (spathes), et une masse de longs stigmates s'échappent au sommet des spathes en une touffe de filaments (soies) (Hitchcock et Chase, 1971). 2.Répartition géograph
BIOLOGIE VEGETALE : Histologie et Anatomie Vegetales
(University of Sciences and Technology of Oran, 2021-01-31) CHAA, Lahouari
Ce présent manuel, a pour objectif de présenter les bases de la biologie Végétale pour les étudiants de première année, du domaine des Sciences de la Nature et de la Vie. Dans ce manuscrit, nous avons mis l’accent, essentiellement sur l’aspect anatomique et histologique du végétal.
Taxonomie et systématique des végétaux inférieurs
(University of Science and Technology of Oran, 2021-01-31) Saliha Meliani
Ces dernières années, le développement des technologies de communication et des dispositifs intelligents ont conduit au déploiement de nouveaux services, d’objets communicants ou internet des objets. Dans ce contexte, l’importance de L’internet d’objets paraît évidente dans la vie quotidienne. Notre travail consiste à extraire des données pertinentes qui entourent un utilisateur dans une maison intelligente, en déduisant des données contextuelles qui nous permettront d’enrichir le profil de cet utilisateur, en se basant seulement sur les données sonores détectées par des capteurs audio installés dans la maison intelligente, ou sur le corps, afin de personnaliser des services au profit de l’utilisateur.
Immunopathologie
(University of Sciences and Technology of Oran, 2021-04-18) BENSABER Hayette Sénia
Le présent polycopié constitue un support de cours destiné aux étudiants de Master II spécialitéGénétique Fondamentale Appliquée. Il vise à leur transmettre les différentesconnaissances de base sur les grandes fonctions, les organes lymphoïdes, les celluleset les molécules du système immunitaire : Anticorps, récepteurs et HLA.Acquisition des connaissances nécessaires concernant le dysfonctionnementdu systèmeImmunitaire en association avec diverses pathologies.De nombreux progrès en matière d'immunobiologie des tumeurs et du fonctionnement du système immunitaire ont été réalisés au cours des dernières années. La démonstration que des tumeurs peuvent régresser parfois complètement sous stimulation immunitaire appropriée confirme qu'il est possible de traiter les cancers par la manipulation du système immunitaire. Néanmoins, ces résultats restent rareset les échecs peuvent être dus à l'inadéquation des méthodes utilisées(nombre insuffisant de lymphocytes dans les tumeurs, nécessité de générer à la fois des lymphocytes CD4 et CD8, la survie et l'efficacité de ces derniers nécessitant des facteurs sécrétés par les CD4) mais aussi aux capacités d'échappement des cellules cancéreuses. Un des challenges actuels est de mieux comprendre les mécanismes par lesquels les cellules tumorales deviennent réfractaires au système immunitaire.Le contenu de ce support de cours a pour objectif également de faciliter la compréhension de toutes les pathologies en corrélation avec lesystème immunitaire.
SYSTEMATIQUE DES PROCARYOTES (Bactéries et Archaea)
(University of Science and Technology of Oran, 2021-06-10) BEGHALEMHAMIDA
Ce manuel regroupe des informations pédagogiques et scientifiques qu’un étudiant de Licence Microbiologie doit savoir sur la Systématique des Procaryotes il explique toutes les bases de ce cours de façon chronologique.Ce document est un outil d’enseignement universitaire, est la suite et l’approfondissement des connaissances acquises en L2 (S4) : U.E. de Microbiologie générale. Il s’adresse principalement aux étudiants en biologie (Licence) et a pour objectif d’aboutir à un diagnostic bactériologique de l’ensemble des bactéries et des Archaea selon les données de la nouvelle édition du Bergey’s Manual (Vol 1, 2, 3, 4 et 5). En plus des caractères classiques de détermination des procaryotes, l’apport de l’outil moléculaire sur lequel se base le Bergey pour l’identification des bactéries et des Archaea est d’une grande importance.Ce Manuel est inspiré du programme proposé dans le canevas de Licence Microbiologie pour la matière Systématique des Procaryotes (Bactéries et Archaea)
Physiologie Cellulaire et Moléculaire
(University of Sciences and Technology of Oran, 2022-01-05) ATHMANI, Nora
La matière de physiologie cellulaire et moléculaire permette de démontrer le mode de fonctionnement par lequel passent les cellules pour assurer leur rôle et leur mission au sein de l'organisme, car la cellule est la plus petite unité fonctionnelle d'un organisme. Ce module désigne également l'étude de ce fonctionnement et des propriétés des cellules. Il souligne également les démarches expérimentales utilisées pour la compréhension de l'organisation structurale et fonctionnelle de la cellule. Les modèles membranaires, la composition des membranes, les radeaux lipidiques, le transport membranaire, le cytosquelette (structure, synthèse et fonction), la division cellulaire et la différenciation, les récepteurs et la réception, la croissance et le développement des cellules, la mort cellulaire sont également abordées afin d'illustrer la spécialisation cellulaire, ses effets sur les adaptations de structure et de fonction. À l'issue de ce cours, l'étudiant sera en mesure de : - Décrire les structures observées dans une cellule et leurs fonctions; - Comprendre le fonctionnement des organismes vivants à l'échelle de la cellule - Intégrer le concept d'unité de vie (la cellule) malgré la diversité d'organisations, de formes et de fonctions des êtres vivants - Expliquer des processus cellulaires ;  Le transport membranaire ; utiliser correctement et pertinemment les concepts de flux et de perméabilité et est capable d'expliquer précisément la loi de Fick et les principes de l'osmose, les échanges d'eau à travers les capillaires et les bases biophysiques, les flux et les forces qui contrôlent les flux d'ions, l'origine du potentiel de membrane, décrire les propriétés de base et les paramètres de tous les canaux ioniques ainsi que les différentes familles de canaux ioniques, de différencier diffusion passive, transports facilités et transports actifs primaires et secondaires en fonction de leurs sources d'énergie, leurs mécanismes moléculaires et leur couplage énergétique,  La biosignalisation, la communication extracellulaire, l’influx nerveux, la contraction musculaire, la défense immunitaire, la sénescence; en termes d'interactions physico-chimiques et moléculaires entre composants cellulaires, expliquer les mécanismes de la transmission de l'information nerveuse, la défense immunitaire. Il est également capable de décrire les mécanismes la mort cellulaire programmée. Les compétences visées par le cours seront développées à l'aide d'exposés magistraux, incluant des exemples concrets. Les acquis d'apprentissage étant très larges pour le cours donné, il est proposé de mettre l'accent sur la démarche qui vise à atteindre une bonne compréhension de la problématique donnée. Cette démarche pourrait être volontairement proposée pour un exemple qui représente un sous-ensemble de la problématique (par exemple, un facteur de croissance ou un neurotransmetteur) plutôt que pour l'ensemble de celle-ci.
METHODES D’ANALYSES BIOLOGIQUES
(University of Sciences and Technology of Oran, 2022-01-18) BENYAHIA-MOSTEFAOUI, AICHA
Toutes les méthodes d'analyse donnent des résultats présentant un certain degré d'incertitude, qui doit être pris en compte lorsqu'on choisit la méthode à utiliser à une fin particulière. Cette incertitude peut avoir des incidences importantes lorsqu'une concentration donnée d'une substance constitue un niveau d'intervention. Les méthodes de caractérisation et d'analyse sont indispensables pour vérifier la composition des produits (chimique, pharmaceutique, agro-alimentaire, eau, etc.) et des matériaux. «Techniques d'analyse» permet de connaître les possibilités et les limites de chacune, les instruments utilisés et de faire un choix judicieux face à un problème donné. On doit connaître les caractéristiques de performance "interne" d'une méthode analytique pendant la période considérée lorsqu'on l'utilise sur des substances à analyser. Toute méthode analytique utilisée sur des substances à analyser doit être appliquée de manière cohérente et accompagnée de procédures de contrôle de la qualité. Une analyse utilisant une méthode sur des substances à analyser doit avoir fait la preuve de sa compétence en la matière pendant la période considérée. Il doit y avoir des preuves documentaires que chacun de ces principes est observé. Le client et l'analyste doivent être bien d'accord sur la manière dont les données doivent être utilisées si l'analyste doit produire des résultats de "qualité" (c'est-à-dire aptes à leur emploi). Le choix de la méthode d'analyse doit tenir compte de la nature des résultats recherchés. Ce polycopié représente le programme qui est destiné aux étudiants licence-master-doctorat (LMD) en nutrition alimentaire et pathologique en unité d’enseignement découverte selon le nouveau CANEVAS. Il a été conçu dans le souci d’en faire un document assez riche pour donner à l’étudiant les notions de base lui permettant de comprendre les Méthodes et Techniques d'Analyses Biologiques 1 (MTAB1) et vise à former des professionnels capables de mettre en œuvre les techniques d'analyses courantes et récentes, de participer à des développements analytiques nouveaux et de s'adapter à l'évolution des métiers de l'analyse
Technique de Contrôle Microbiologique
(University of Sciences and Technology of Oran, 2022-03-30) Yamina, MERZOUK
La recherche de la qualité au sens large est actuellement une préoccupation fondamentale pour l’industrie agroalimentaire. La qualité se définit à partir de système de référence, exemple : normes, labels, appellation. Elle s’obtient par l’application de procédures bien définies et maitrisées. Elle se contrôle par des systèmes de vérification et des techniques d’analyses standardisées. Au niveau microbiologique, l’hygiène est une donnée fondamentale. Les objectifs de la sécurité servent à identifier et valider la nature et l’efficacité des suivis de fabrication, tels que surveillance renforcée à certains points critiques de maitrise, et d’investigations microbiologiques approfondies. L’ensemble de ces activités visant à réduire la variabilité des résultats obtenus et la probabilité de mettre sur le marché des produits non satisfaisants. Dans ce contexte l’analyse microbiologique des produits finis reste indispensable, car elle permet avec une certaine inertie d’éviter, dans le cas où des produits dangereux ou non conformes seraient fabriqués, leur commercialisation ou leur consommation. Ce type de contrôles est souvent pratiqué par des laboratoires officiels