Ecologie des microorganismes

Abstract

Le polycopié des Travaux Pratiques du module « Écologie des Microorganismes », destiné aux étudiants de Master 1 en Microbiologie Appliquée, se compose de quatre séances principales, chacune visant à illustrer un aspect fondamental de l’écologie microbienne à travers des expériences pratiques. Le TP1 est consacré à la colonne de Winogradsky, un micro-écosystème simulant les gradients environnementaux et permettant d'observer la stratification des communautés microbiennes et les cycles biogéochimiques (carbone et soufre). Le TP2 étudie l’effet antagoniste de Trichoderma sur des champignons phytopathogènes, illustrant le potentiel de ce genre fongique en biocontrôle agricole. Le TP3 porte sur l’isolement et l’identification des bactéries provenant de divers écosystèmes à l’aide de techniques de culture, de coloration de Gram et de tests biochimiques, avec un focus sur les entérobactéries, les Pseudomonas et les Bacillus. Enfin, le TP4 explore l’activité enzymatique des microorganismes (amylase, cellulase, protéase, lipase), essentielle pour la dégradation de la matière organique et les applications biotechnologiques. Ce document met l’accent sur l'acquisition de compétences pratiques et l’interprétation écologique des résultats, contribuant à la formation des étudiants dans le domaine de la microbiologie environnementale